一种具有全面保护的太阳能控制器的充电电路拓扑及控制方法，电路拓扑为：太阳能电池与电感单元、充电控制开关单元、防倒流开关单元、辅助开关单元和蓄电池串联构成充电主回路，二极管单元、电感单元、防倒流开关单元、辅助开关单元和蓄电池串联构成充电续流回路。控制方法为：充电控制开关单元采用PWM模式；在充电过程中，对防倒流开关单元施加正向驱动电压；当没有太阳光时，控制防倒流开关单元可靠关断；当蓄电池正常连接时，控制辅助开关单元正常导通；当蓄电池反接时，控制辅助开关单元可靠关断。本发明充电电流连续性好，能提高最大功率点跟踪效率，具有防倒流、太阳能电池极性反接保护、蓄电池极性反接保护、过流保护、防雷保护等功能。