一种微电网中有源电力滤波器的远程控制系统，包括滤波器、触摸屏、上位机、控制器，控制器分别与有源电力滤波器、触摸屏以及上位机连接；有源电力滤波器还用于与微电网连接。上述微电网中有源电力滤波器的远程控制系统，利用上位机通过远程地操控有源电力滤波器，使得有源电力滤波器提取该微电网中的谐波与无功分量后进行相对的补偿，有效地解决了微电网中的有源电力滤波器的远程监测、控制问题，实现了远程监测和控制，即不在现场也可对微电网及有源电力滤波器的运行状态进行监测记录，对有源电力滤波器的运行模式进行切换，并在微电网或设备不正常工作情况下及时进行投切操作。