本发明涉及电能质量补偿技术领域，尤其涉及一种带高频隔离环节的电能质量综合补偿器与控制方法，包括：带Z源的高频环节AC/AC变换器、驱动电路、用于控制所述驱动电路工作的控制电路、电压检测电路以及检测判断电路，所述电压检测电路、以及检测判断电路分别于所述控制电路连接，所述控制电路与所述驱动电路连接，所述驱动电路与所述带Z源的高频环节AC/AC变换器连接。通过附加Z网络，可以控制占空比实现变换器的升降压以及极性变换，电压补偿范围宽，控制方便、简单，用带Z源的高频环节AC/AC变换器取代工频变换器，没有中间储能电容，降低了装置的体积、重量、成本，提高了系统的可靠性。